Жоғары спорт шеберлігі мектебінің тарихы 2002 жылдан бастау алады. Сол жылы Алматы қаласы әкімдігінің шешімімен №3 Арнайы балалар мен жасөспірімдер олимпиадалық резерв мектебі (СДЮШОР №3) құрылды. Мектептің негізгі мақсаты – республикалық және халықаралық жарыстарға қатысу үшін спорттық резервті дайындау және талантты спортшыларды дамыту болды.
2010 жылы жоғары спорттық шеберлік жүйесін дамыту және спортшыларды даярлаудың тиімділігін арттыру мақсатында мектеп Алматы қаласының Жоғары спорт шеберлігі мектебі ретінде қайта ұйымдастырылды. Жаңа мәртебе спортшыларды жоғары деңгейде даярлауға басымдық берді.
Қазіргі таңда Жоғары спорт шеберлігі мектебі Алматы қаласындағы халықаралық деңгейдегі спортшыларды дайындайтын маңызды орталықтардың бірі. Мектепте тәжірибелі жаттықтырушылар, спорт саласының құрметті мамандары мен кәсіби мамандар жұмыс істейді, олар спортшыларды олимпиадалық және олимпиадалық емес спорт түрлері бойынша даярлайды. Біздің спортшыларымыз әлем және Азия чемпионаттарына, Әлем кубогының кезеңдеріне, Олимпиада ойындарына, халықаралық турнирлерге және республикалық жарыстарға тұрақты түрде қатысып, жоғары дайындық деңгейін көрсетеді.
Бүгінде біз дамуды жалғастырып, спортшыларды дайындау жүйесін жетілдіріп, жаттығу процесіне заманауи әдістемелерді енгізіп, Алматы қаласын елдің жетекші спорттық орталықтарының бірі ретінде нығайтудамыз.